抗日战争时期，华北某地。我八路军的一座兵工厂突然发生爆炸，保卫部周部长（浦克 饰）断定是敌人所为，急令侦察科王科长（庞学勤 饰）立即侦办，同时派部队搜索追踪。王科长在搜索途中，发现在一座古庙附近有一具尸体和两把刀，周部长认为古庙里大有文章，他安排王科长以养病为由带虎子（李希达 饰）进庙侦察，奇怪的是庙里只有一老一小俩和尚。小和尚（陈克然 饰）原本不是哑巴，五年前，庙里香火正旺，突然冲进来一伙匪徒把正在念经的众和尚全杀了，幸存下来的小和尚被害成哑巴。通过日夜侦察，王科长发现这里潜伏着一个极其危险的地下特务组

浙江人才臣与陕西人燕赤霞邂逅于金华一古庙。夜深，一女子携金元宝忽至才臣床边要与其同床共枕，才臣驱走女子并扔出所留金元宝。次日，后东厢兰陵书生主仆二人莫名暴毙。原来此女叫聂小倩，是一位早年夭亡的少女，尸骨埋于庙旁，夜间以夜叉面目出现，并以色相和金钱引诱生人而食。小倩不忍加害才臣，嘱咐才臣与燕生同眠避祸，日后将其尸骨挖出归葬。燕赤霞乃一炼剑侠士，在夜里他施术击伤一破窗而入的鬼物。才臣不负小倩之托将其尸骨带回重葬，前脚到家，小倩不期而至，母亲对这个来路不明的少女心生疑惑。

1937年一名女子被发现死于狐狸塔下，凶手将她残忍地杀害。而警方的调查则草草锁定了几个嫌疑人：一名黄包车夫与一位神秘男子。历史迷雾重重，这个曾轰动北平的案子藏在时间的尘埃里，而使其浮出表面的却是这个不起眼的注解。